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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
（新春走基层）山西长子冬日草莓映红致富路 谱写乡村振兴“莓”好乐章******
中新网长治2月3日电 题：山西长子冬日草莓映红致富路 谱写乡村振兴“莓”好乐章
作者 杨静 张月
冬日暖阳好，草莓采摘忙。3日，走进山西省长治市长子县南陈镇庞庄村草莓大棚内，绿意盎然，草莓清香扑鼻而来。一垄垄草莓植株排列整齐、生机勃发，一颗颗草莓色泽红亮、果肉饱满，前来采摘草莓的游客品尝着香甜的草莓，享受着新春悠闲时光。
草莓红艳艳，“莓农”笑开颜。管护秧苗、查看棚温……正在草莓大棚里忙活着的付雄旺是这些草莓的“大管家”，“去年10月种植了3亩多草莓，主要有奶油、红颜、天使AE等品种。”
“草莓种植过程中全部使用有机肥，让大人孩子都能吃得放心。”付雄旺说，目前大棚草莓处于成熟期，个大味甜口感好，正值正月里，家长带着孩子前来体验采摘的较多，预计采摘期将持续到5月份。
游客冯康与朋友们正在草莓园采摘，“假期休闲，放松心情。现场采摘的草莓自然成熟，都比较新鲜。”冯康说：“今天收获满满，希望今年的生活也能红红火火、甜甜蜜蜜。”
目前大棚草莓处于成熟期，预计采摘期将持续到5月份。 长子县融媒体中心提供庞庄村地处长子县西南山区，虽然地理位置偏僻，但土壤肥沃，植被丰富，依山傍水，环境优美，是当地发展“金山银山”风景区的窗口。近年来，庞庄村借助乡村旅游的东风，不断推进“农林文旅康”融合发展。
庞庄村党支部书记付三文介绍，2022年5月起，在长子县农业农村局等相关部门和南陈镇的协调指导下，庞庄村流转农户土地，投资25万元左右，盖起两个日光温室大棚用来种植草莓，“预计每年能为村集体增加收入15余万元。”
“下一步，村里计划继续完善草莓园周边基础设施建设，将草莓园打造成以游客采摘为主、商超供货为辅的综合性日光大棚。”付三文告诉记者，村里还计划通过线上电商平台等方式进行宣传，吸引更多游客来观光采摘。
“希望通过特色草莓种植及康养小镇建设带动乡村游、采摘游、观光游的进一步发展，奏响庞庄村乡村振兴‘莓’好乐章。”付三文说。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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